Žluté zimnici lze zabránit očkováním, které poskytuje dlouhodobou imunitu (více než 10 let), účinnou u 90-95% příjemců.
Vakcína, v současné době schválená Světovou zdravotnickou organizací, se skládá ze živého a oslabeného viru 17D žluté zimnice, pěstovaného na kuřecím embryu. Vakcína se podává formou jednorázové injekce do horní části paže, která se má každých 10 let obnovit. Ochranné protilátky se objevují 7-10 dnů po inokulaci.
Očkování, kromě toho, že je povinné pro některé destinace, je však doporučeno pro cestující, kteří cestují do endemických oblastí Afriky a Ameriky. Na druhé straně je vakcína proti žluté zimnici kontraindikována u dětí před 4 měsíci au těhotných žen; zvláštní opatrnost se doporučuje také u osob alergických na kuřecí nebo vaječné bílkoviny, u imunokompromitovaných jedinců v důsledku onemocnění nebo terapií, u dětí mladších 9 měsíců au starších osob.
