V současné době není k dispozici vakcína nebo lék pro profylaxi proti africké trypanosomii . Preventivní opatření jsou proto zaměřena na minimalizaci kontaktu s tse-tse mouchami.
Nejprve je třeba se vyhnout zamořeným oblastem. Létání tsetse je méně aktivní v nejteplejších hodinách dne, ale může zaútočit, pokud je naštvaný. Je třeba mít na paměti, že tento hmyz je přitahován pohybujícími se objekty a světlými nebo tmavými barvami; může také žít s lehkým oblečením. Proto se doporučuje nosit košile a kalhoty, které co nejvíce pokrývají končetiny; Přednost se dává zejména oděvům z odolného materiálu a neutrálním barvám, které se mísí s prostředím. Aplikace repelentů na oděvy může být také užitečná. Roje tse-tse mouchy mohou následovat pohybující se vozidla, takže je vhodnější zavřít okna automobilů, aby se zabránilo vniknutí do kabiny.
Boj proti vektorovému hmyzu může být prováděn na úrovni životního prostředí s likvidací stanovišť pro reprodukci, použitím insekticidů a pastí (lépe, pokud jsou impregnovány permethrinem) v místech úkrytů pro mouchy tse-tse (peeling savany). a vegetace podél vodních toků) a léčba parazitovaných subjektů (zdroj infekce pro nosiče).
