Původ viru Ebola není znám, ale na základě dostupných důkazů je ovocný netopýr považován za přirozený rezervoár patogenu.
Ovoce netopýři, lépe známý jako létající lišky, jsou velké netopýry, kteří obývají říční lesy . Jsou známy alespoň tři druhy netopýrů zdravých virů (Ebola v tomto zvířeti nezpůsobuje žádné příznaky): netopýr bradavičnatý (Hypsignathus monstrosus), netopýr ovocný z pařbu Franquet (Epomops franqueti) a netopýr ovocný z límce (Myonycteris torquata).
Jak ale infekce přecházela ze zvířat na lidi? Pro obyvatele Afriky, veterány občanských válečných let, jsou netopýři zdrojem výživy. Nejen to. Západní a čínské společnosti vstupující do džungle pro odlesňování a hledání nerostů zvýšily praxi masa z křovin, tj. Obchodu a spotřeby masa z volně žijících zvířat. Muži, proto, jíst antilopy nebo šimpanzy nakažený netopýry ( přechodní hostitelé ), moci se zkrátit Ebola virus a šířit infekci.
