Africká trypanosomóza je většinou nakažena kousnutím infikované mouchy tsetse . Je však možné i vertikální přenos z matky na dítě během těhotenství. Trypanosom může ve skutečnosti procházet placentou a infikovat plod. Přenos přes jiný hmyz, který se šíří krví, není vyloučen, i když tento mechanismus musí být vyjasněn.
K náhodným infekcím došlo mezi zdravotníky a laboratořemi v analytických laboratořích po propíchnutí kontaminovanými jehlami .
