Diagnóza žluté zimnice není jednoduchá, protože klinický obraz se může projevit obtížně odlišitelným symptomem od jiných virových hemoragických horeček, malárie, tyfusové horečky, leptospirózy, dengue a hepatitidy.
Proto by měla být u pacientů v endemické oblasti podezření na náhlou horečku s bradykardií a žloutenkou. Laboratorní testy provedené okamžitě v kvalifikované nemocnici umožní potvrzení nebo vyloučení diagnózy.
Výzkum použitelný pro tento účel zahrnuje krevní obraz, vyšetření moči, testy jaterních funkcí, buněčné kultury a retro-transkripci polymerázovou řetězovou reakcí (RT-PCR). Diagnostické potvrzení je zajištěno přítomností specifických protilátek detekovaných pomocí sérologických testů, jako je ELISA (enzymově spojený imunosorbentní test).