Pacienti, kteří mají kontrakt Ebola jsou nakažlivé, dokud krev a sekrece obsahují virus v aktivní formě.
Mikroorganismus je však také izolován ve spermiích mužů, kteří jsou touto chorobou uzdraveni. Z tohoto důvodu je důležité zdržet se pohlavního styku nejméně sedm týdnů po zotavení.